保和宮供奉的主祀神為保生大帝。原自大陸白礁分靈至金鞍山，再由兌山李氏先祖恭迎金身來台，保生大帝的信仰在台灣相當普及，這與台灣的大多數住民先祖來自閩南地區有關。保生大帝又稱「大道公」「吳真君」「真人先師」「花轎公」「英惠侯」…等，他是周代泰伯皇帝的後裔，初分封金陵，建國吳縣，傳至三十一世時，一分支，遷入福建省泉州府同安縣白礁鄉，就是保生大帝的先祖。
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幼年的保生大帝，身材高大，聰穎活潑，喜愛讀書，對天文、地理、禮樂、醫藥均有專研，在歧黃之術上有精闢的見解，據說他17歲時曾遊崑崙山，遇見西王母，王母授予濟世廟方及斬妖伏魔之法。
宋仁宗明道元年〈西元一零三二年〉，福建漳、泉一帶旱災嚴重，瘟疫橫行，保生大帝出錢出力，到處脤災，而且亦帶著學生們下鄉為鄉民們醫治疾病，他們借住在花轎亭客棧，免費行醫救人無數，幾年後，鄉人感念他的義舉，便在花轎亭蓋了一座「真人宮」，表示對這位偉人的敬意，也因為如此，後人也尊稱他為「花轎公」。
王母娘娘傳授醫術：
據《台灣縣志》記載：「保生大帝長大後，專於醫藥，以活人為心，按病投藥遠近皆以為神。」因此民間就有許多他習醫的傳說，留傳最廣的傳說就指出他十七歲時，有一天在海邊賞月，突然出現了一位神仙，由天而降，帶他駕著祥雲前往崑崙山，拜見西王母，西王母見他聰穎過人，懷有一顆濟世之心，因此就傳以神方濟世和驅魔逐邪的工夫，並贈送他一本珍貴的醫書。他返家後潛心修習醫術，幾年後，他便外出遊歷名川、大山；印証所學醫術，所以能有妙手回春之醫術。
起死回生的神蹟：
相傳宋神宗祥符七年，保生大帝曾在河南一帶行醫，有一回在一座樹林中，見到了一副骨骸，少了一根左腿骨，於是他就取了一段柳條，置於骨骸左腿之處，念了咒語，這副枯骨就頓時成為一個童子的模樣，跟隨他到處行醫。
有一天他們竟然在路上碰到這個童子原本的主人，名叫江仙官，江仙官相當驚訝！因為在幾個月前，他明明見到自己的童僕被大老虎叼走，此時他的這位童僕居然死後復生。他不相信保生大帝能令死人復生，於是大帝將童僕再度變回枯骨，江仙官佩服的五體投地，於是棄官從醫，追隨保生大帝四處行醫，這也就是後來民間流傳「神方活骨，江張從師」由來。
絲線診脈醫國母：
相傳明成祖年間，皇后患有乳疾，求訪天下名醫莫救，突有道士自稱住白礁鄉名吳夲，自稱能醫治皇后重病，並言能以絲線診脈。成祖先以絲線繫於皇后玉鐲、貓身，皆被真人識破，成祖驚異，乃命內侍繫絲線於皇后手腕，斷為乳疾，並隔屏指示施以針灸，乳疾頓消。成祖欲賜予官爵財寶，皆辭不受，騎鶴而去。皇后感其恩德，乃立國母獅於福建白礁慈濟宮廟庭之內。又一說是文皇后生病後夢見有一道人牽紅絲線為其切脈，後來用艾條灸之，醒來之後已經痊癒。事後明成祖遣人尋找，在白礁發現吳真人的神像，為了感恩而贈與白礁慈濟宮「國母獅」。
點龍睛：
保生大帝在行醫途中，有一回在山中的深澗旁，遇到了一隻害了眼疾的龍，這條龍化為山中的樵夫，請求保生大帝位他醫治眼疾，大帝識破他龍的身份，這條龍伏地請求大帝救治，於是保生大帝用符水點於龍眼 ,治好了他的眼疾，也因此贏得了「點龍睛醫虎喉」的美譽。
醫虎喉：
保生大帝的神像常被塑成有虎為伴或以騎虎姿態出現，相傳，有一隻猛虎常常在山間為害吞食路人，有一天吞食了一位盛裝的婦人，被婦人的髮髻哽刺喉嚨，老虎至保生大帝處求治，保生大帝告知，若要位祂醫治，則必須永不害人。醫好後，老虎遂跟著保生大帝成為其坐騎，大帝成仙後，老虎也跟著成神，成為民間信仰的虎爺，台灣民間虎爺的信仰，或許真的緣起保生大帝的奉祀也說不定。
泥馬渡康王：
相傳北宋末年靖康之難發生，欽、徽兩宗被金人擄走，金兵南侵，宋高宗繼位之初，時局不穩，一路往南奔逃，在慌亂之中與隨從走散，當被金兵逼至江邊之際，正在危難時，突然出現一匹馬停在不遠之處，慌忙之中，他騎上此馬渡江逃走，而一回頭竟然發現從天而降許多天兵神將為其阻擋金人。也因為如此，宋高宗才得以順利脫逃，由於又飢又渴，當夜宋高宗夜宿一間古廟，疲倦中昏然入睡，隔天早晨起來準備再騎馬往南尋找部將，發現馬匹竟然消失，在廟中到處搜尋之時，突然發現此廟是供奉保生大帝的廟宇，而廟宇中廊道的泥塑馬匹，與他昨夜所騎的馬匹非常相似，而且身上正一滴滴的滴著水。這時，宋高宗才恍然大悟，發現昨夜是保生大帝救了他的命，因此在紹興 21年起，宋高宗下詔命令地方官在保生大帝的故鄉立廟，奉祀吳本。傳至宋孝宗又賜名「慈濟靈宮」並賜諡「大道真人」，之後歷代皇帝都有封賞。慶元初年、寧宗敕封「忠顯侯」、嘉定年間敕封「英惠侯」、寶慶三年，理宗敕封「康祐侯」，四年再敕封「沖應真人」，五年又敕封「妙道真人」。
大道公與媽祖婆：
大道公風，媽祖婆雨：由於天上聖母媽祖與保生大帝大道公皆為北宋福建人士，民間傳說遂附會二神相戀，後媽祖見母羊生產苦狀，悔而辭婚。保生大帝憤而與媽祖施法相鬥，於媽祖誕辰降雨洗其脂粉，媽祖亦不甘示弱，於大道公誕辰施法刮風，吹落道帽。故稱「大道公風，媽祖婆雨」，此一傳說穿插閩南暮春節候，與地方神祇傳說，頗富人情趣味。然而亦有地方信徒，以為褻瀆神明，深不以為然。媽祖生於宋太祖建隆元年，而保生大帝生於宋太宗太平興國四年，媽祖十九歲時，保生大帝才出生，何況媽祖二十八歲成道，兩人有婚嫁聯想，實在不可能。
其他的如保生大帝「騎鶴退洪水」、「救朱元璋於陽湖」…等神蹟，不勝枚舉，由於太靈驗，同安縣人就把保生大帝奉為主神，每當有移民渡海來台，就會攜帶他們所奉祀的保生大帝，或迎奉分身，在台灣各處建廟奉祀保生大帝，據統計全臺保生大帝的主廟就高達140所以上。
在所奉祀保生大帝的廟宇之中，最特殊的一點，就是廟中都設有藥籤。因此對病人或病人家屬來說，到保生大帝的廟宇來，除了可祈求神明保祐外，也可以來求藥方，再到中藥房抓藥回去給病人吃。
這種藥籤，大致上來說和一般抽詩籤問吉凶的方式並無不同，但是抽藥籤之前除了祈禱外，還必須將病情陳述一番，讓保生大帝知道後，再從籤筒中抽竹籤一支，並擲筊來決定是否為適合之藥籤。由於信仰上的治療，或多或少對病情有有所助益，因此數百年來保生大帝的信仰，歷久不衰，原因在此。
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