由於民進黨政府希望於2025年進入非核家園，因此致力進行能源轉型，希望能全面停止核能電廠的運轉。但以核養綠公投發起方並認同，認為不用核電就只能「火力全開」，造成嚴重空汙，因此發起公投希望民眾表態。
環保團體多次開記者會說明，在扶植綠能的部分，此公投案，不但在主文中未提及綠能，且相較於蔡政府提出的2025年非核家園計畫，綠能佔比達到20％，公投提案方所提出的能源配比，綠能僅佔10％，讓許多環保團體質疑，提案方式不是只想要「以核擋綠」。
而以核養綠的公投方認為，由於火力發電容易造成空氣汙染，應採用核能發電降低空氣汙染。
地球公民基金會執行長蔡中岳反駁，他認為在非核家園政策中，燃氣比例為50％，燃煤30％，再生能源佔20％，但以核養綠的公投方所提到的能源配比為，綠能10%、核能20%、天然氣30%、燃煤40%，燃煤發電的比例相較於原先的政策多出了10％，也就是說以核養綠的方案沒辦法有效的減低空汙，可能會更加嚴重。
而過去曾絕食反對核四興建的前民進黨主席林義雄也表態反對以核養綠公投，擔心核電死灰復燃，且認為應該民眾應該要踴躍在公投案表達意見。黃士修對此批評，林義雄在此時站出來毫無意義，根本就是依附民進黨政策的假貨，根本沒有想要讓人民表達意見。
在此次的大選公投中，此案最晚成案，因為公投提案方在9月6日時將約31萬4,000份連署書送至中選會。由於首次送件後，擔心31萬份的聯署名單可能僅達及格邊緣，其中恐有格式不符的聯署書，於是希望於13日將補件送至中選會。
但13號補件時，卻遭到中選會拒收，領銜人黃士修表示，根據《公投法》規定，成案要在11月24日大選前1個月，也就是10月24日前公告就可以公投綁大選。他提到，若再加上戶政事務所查對的審查期與中選會10天作業流程，9月14日才是截止日期，他認為中選會沒有權限拒收。
「收了是違法。」中選會主委陳英鈐先前表示，進行點收作業後，若是份數不足才需補件，而若份數足夠，就趕快送戶政機關查對。她表示，當時第一階段以核養綠就有31萬餘份連署書，已超過28萬餘份的門檻，完成點收後就送戶政機關查對，不能再次點收，她也認為，中選會不得給某項公投特別優惠。
由於中選會不收件，黃士修認為，中選會是有意「搓掉此案」，為了向中選會施壓，開始展開絕食行動，但他在19日時絕食140小時體力不支送醫，由其他侯漢廷等人接力絕食。由於颱風接近，26日宣布結束長達三周的絕食行動，並表示「既然中選會不收，我們也就不給了！」
10月16日中選會開會決議，以核養綠經戶政機關查對後，合於規定人數僅27萬9419人，與與成案門檻28萬1,745份仍差2,326份，並未過關。而黃士修於17日補件2萬3,251份連署書。
在23日時，經過戶政事務所查對後，連署人數為1萬4,891人，刪除不符規定1,656人後，共1萬3,235份連署書合格，加總後為29萬2,654人，達人數門檻，確定成案。
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而以核養綠的公投方認為，由於火力發電容易造成空氣汙染，應採用核能發電降低空氣汙染。
地球公民基金會執行長蔡中岳反駁，他認為在非核家園政策中，燃氣比例為50％，燃煤30％，再生能源佔20％，但以核養綠的公投方所提到的能源配比為，綠能10%、核能20%、天然氣30%、燃煤40%，燃煤發電的比例相較於原先的政策多出了10％，也就是說以核養綠的方案沒辦法有效的減低空汙，可能會更加嚴重。
而過去曾絕食反對核四興建的前民進黨主席林義雄也表態反對以核養綠公投，擔心核電死灰復燃，且認為應該民眾應該要踴躍在公投案表達意見。黃士修對此批評，林義雄在此時站出來毫無意義，根本就是依附民進黨政策的假貨，根本沒有想要讓人民表達意見。
在此次的大選公投中，此案最晚成案，因為公投提案方在9月6日時將約31萬4,000份連署書送至中選會。由於首次送件後，擔心31萬份的聯署名單可能僅達及格邊緣，其中恐有格式不符的聯署書，於是希望於13日將補件送至中選會。
但13號補件時，卻遭到中選會拒收，領銜人黃士修表示，根據《公投法》規定，成案要在11月24日大選前1個月，也就是10月24日前公告就可以公投綁大選。他提到，若再加上戶政事務所查對的審查期與中選會10天作業流程，9月14日才是截止日期，他認為中選會沒有權限拒收。
「收了是違法。」中選會主委陳英鈐先前表示，進行點收作業後，若是份數不足才需補件，而若份數足夠，就趕快送戶政機關查對。她表示，當時第一階段以核養綠就有31萬餘份連署書，已超過28萬餘份的門檻，完成點收後就送戶政機關查對，不能再次點收，她也認為，中選會不得給某項公投特別優惠。
由於中選會不收件，黃士修認為，中選會是有意「搓掉此案」，為了向中選會施壓，開始展開絕食行動，但他在19日時絕食140小時體力不支送醫，由其他侯漢廷等人接力絕食。由於颱風接近，26日宣布結束長達三周的絕食行動，並表示「既然中選會不收，我們也就不給了！」
10月16日中選會開會決議，以核養綠經戶政機關查對後，合於規定人數僅27萬9419人，與與成案門檻28萬1,745份仍差2,326份，並未過關。而黃士修於17日補件2萬3,251份連署書。
在23日時，經過戶政事務所查對後，連署人數為1萬4,891人，刪除不符規定1,656人後，共1萬3,235份連署書合格，加總後為29萬2,654人，達人數門檻，確定成案。
