國民黨立委王鴻薇、前立委蔡正元質疑，陸軍關渡地區指揮部便帽上的國旗變成綠色，喊話國防部，請記得國軍是中華民國的國軍，「不是民進黨的國軍，更不是綠色產業鏈的國軍」。國防部解釋，這是「低視度迷彩設計」樣貌，民進黨立委也說，其他國家國軍的國旗也有類似的設計。
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「綠國旗」到底是不是「低視度迷彩設計」？引發兩派混戰。批評者認為，陸軍便帽的正面老虎，仍是黃色，前海軍艦長黃征輝24日就表示，「如果我今天是陸軍司令，我會把這個人叫過來，是誰下令？誰做的決定，我會把這個人重辦」。但立場偏藍的國民黨國際部主任、淡江大學副教授黃介正則在臉書說，海軍的臂章確實也是綠國旗。
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無論如何，綠國旗並不是第一次出現。事實上，蔡英文在過去幾次漢光演習，身穿數位迷彩裝，蔡英文的臂章就是綠色國旗。但有趣的是，前總統馬英九2015年「國家政軍指揮中心」（圓山指揮所）視導政軍兵推，穿著新式數位迷彩服亮相，但馬英九胸前的國旗，就是相當鮮艷的青天白日滿地紅國旗。