近期美國豬肉輸入台灣後，經業者加工卻被「標示不實」，引發民眾不安，美國在台協會（AIT）日前為此發表聲明，強調美方對產品品質有充滿信心，也同意食品應該要正確標示。但衛福部長薛瑞元今提到，其實有時候會收到AIT的抗議，問「為何台灣這樣」，且薛也擔憂，希望社會中不用給美豬安上不安全的抬頭，否則可能引起國際貿易上的歧視問題。
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近期爆出多件美國豬肉輸台後、業者未如實標示產地事件，包括新北市瑞騰公司桃園工廠、桃園市新興公司等，遭食藥署稽查發現，將美國豬肉製成的重組肉標示為加拿大、英國等國產，而玉釩公司桃園分公司則被民眾檢舉，出貨收據標為加拿大產、外箱卻標示為美國產。
雖衛福部食藥署強調，目前均未有含有萊劑（萊克多巴胺）的豬肉流入台灣，但民眾仍對於相關豬肉產品品質感到不安。外交部長吳釗燮稱，把美豬當成食安問題，與「疑美論」、「反美論」是一環的，應該要追溯是哪些人、政黨或國外勢力，希望操弄台美間矛盾。
對於相關爭議，AIT也曾發布簡短聲明表示，美方對於美國豬肉品質充滿信心，台灣所有美國豬肉均達到並超過台灣各項進口標準，美方也同意所有食品都應該正確貼上標籤。
但薛瑞元今（19）日上午出席立法院衛環委員會會議，會前接受媒體聯訪表示，「美豬標示不實」與「有沒有人在操弄」是兩個不同的問題，其中「標示不實方面」，食藥署與相關單位確實發現到違規案件、有標示不實情事，但是沒有檢出萊劑。
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至於「有沒有人在操弄」方面，薛瑞元表示，合法來台的美國豬肉被炒作為「萊豬」、「毒豬」，這是有可能的，衛福部有時候也會收到AIT的抗議，問為何台灣會出現此類情況。
薛瑞元也強調，美國豬肉輸台至今，目前為止看起來是安全的，如果有標示不實情事，衛福部與主管機關也會調查、處罰，希望社會不用給美豬安上「不安全」的抬頭，否則恐引起國際貿易上的歧視問題。