農業部為防範秋冬禽流感疫情，持續專案進口雞蛋以供調度使用，但先前已有5402萬顆雞蛋因為破損、過期而陸續遭到銷毀，近期藍營更指控，還有3000萬顆庫存蛋可能也要加入待銷毀名單，對此農業部透過新聞稿否認，並強調9月27日即將到期的雞蛋是120萬到130萬顆左右。
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針對藍營相關指控，農業部澄清，5400萬顆待銷毀的雞蛋並非全數來自巴西，而9月27日即將到期的雞蛋也非3000多萬顆，而是120萬到130萬顆左右，因此沒有所謂3000萬庫存可能將到期銷毀的問題。
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此外，農業部指出，若使用液蛋作為庫存方式有效期限可達一年，使用用途廣泛且有彈性，對保障糧食安全有其必要，為了維持滾動安全庫存的基本水位，除了殼蛋以外也會採用液蛋形式庫存，而以此方式保存的雞蛋不會有即將到期銷毀的問題。
此外，農業部怒批，相關評論應本於事實與證據，任意將5400萬顆待銷毀的各國進口雞蛋，拼湊不存在的所謂將銷毀的3000萬顆雞蛋，再將之加總影射成超思公司自進口巴西請口的8000萬顆雞蛋，恣意不當連結，誤導視聽，徒增紛擾，實無必要。