海葵颱風帶來劇烈雨勢，導致南部縣市連續放了兩天假，同時也造成農業災情，根據農業部統計資料，截至9月5日11時，農業產物及民間設施估計損失計2億7,456萬元。
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農業部指出，本次海葵颱風造成農業損失，以臺東縣損失2億2,138萬元，佔比81%居冠；花蓮縣損失2,921萬元，佔比11%；屏東縣損失1,307萬元，佔比5%；高雄市損失886萬元，佔比3％，以上4縣市農損較為嚴重，其餘新竹縣、南投縣、台南市也傳出些許損失。
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農業部表示，農作物被害面積達3,162公頃，損害程度27％，換算無收穫面積853公頃，受損作物主要為番荔枝，被害面積1,836公頃，損害程度19％，換算無收穫面積353公頃，損失金額1億3,730萬元，其次為香蕉、其他柑桔(臍橙)、金針菜及木瓜等。
此外，畜產損失估計為6萬元，受損畜禽主要為肉牛；漁產損失估計為235萬元，受損漁產主要為吳郭魚。