台鐵公司化推動過程不透明，交通部長期以來僅和台鐵企業工會閉門協商，外界多僅能以工會因不滿協商過程、結果，旋即對外放話痛批交通部，得知片面資訊，不過第一線的員工早已對台鐵沉痾苦不堪言，長期的人力缺乏與傳承斷層，讓台鐵安全猶如走在鋼索上一般，台鐵產工秘書長朱智宇受訪表示，台鐵員工對於未來的不確定性人心惶惶，而台鐵在公司化後勢必迎來一波出走潮，不止缺乏經驗傳承，人力的短少問題更是雪上加霜。
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台鐵目前人員編制，分為具有公務員身份、經由鐵路特考入職的資位人員，與不具有公務員身份，但是比照公務員同等福利的營運人員，不過在公司化之後，將新設僅具有勞工身份的「從業人員」，也就是2024年後的新進人員，不過依據產工掌握的人員薪級表，以服務佐理為例，營運人員的薪資將低於從業人員，而這則是台鐵降低人力負擔的手段之一。
「這會讓原本中央承諾待遇不變的營運人員，需要在薪資和待遇上做抉擇。」朱智宇提到，員工轉成從業人員，在薪資封頂的時候享有更高的薪資，但也意味著要放棄營運人員比照的公務員待遇，這個兩難是台鐵局創造「從業人員」以降低營運成本的作法。
不過朱智宇進一步指出，「目前所有的員工對於這樣身份上的異動內容完全不了解。」在產工辦了10場的說明會下來，目前無論是企業工會或是台鐵局，都沒有對外說明薪資待遇調整的進度，「但是這些文件已經在台體的員工之間恣意流傳了，大家只好各自解讀，已經造成員工的恐慌。」台鐵作為維護國家運輸安全的單位，這樣的改制也間接影響到搭乘旅客，相關草案都應該事實證明和員工說明清楚，不要等到相關文件已經到處流竄，甚至是定案了，也一點說明都沒有。
在子法制定中，企業工會雖然有提出2千元的留才津貼，但這樣的津貼對台鐵留才並沒有幫助，且在去（2022）年8月，台鐵調薪時月薪達3萬的營運人員，也就是佔支180薪點的人員，即不適用2千元留才津貼。
▲而人力的問題，就是安全的問題，但台鐵沒有任何人力招募規劃，在子法內也沒有訂定。（示意圖／NOWnews資料照） 魔鬼藏在細節裡，朱智宇指出，今天新進的營運人員佔支160薪點，但由於去年的調薪，月薪為30040元，同等於佔支180薪點，台鐵局認定30040元是「預支」員工未來的薪水，「換言之，可以確定今年到職的營運人員，未來5年內都不會被調薪水，都會維持在180薪點的30040元。」對這些新進人員來說就相當的不公平。
而人力的問題，就是安全的問題，但台鐵沒有任何人力招募規劃，在子法內也沒有訂定。
事實上，運、工、機、電四大工種人員都相當缺乏，台鐵數十年來，都是讓員工用連續上班10幾個小時的輪班方式以維繫鐵路安全，但更嚴重的是，公司化之後可能會有優退、優離或是轉調人員，人員的流失會是台鐵公司起步上的一大打擊。
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朱智宇強調，如果現在不提出計畫，在人才的斷層上也會產生安全風險，以去年9月中秋連假時彰化號誌系統故障事故，居然要找已經退休的老師傅回來修，雖然中央希望透過證照、制度訓練，但在整體規劃還是需要有經驗的老手來帶領時，就得提前規劃。
人員逐年減少，中央或台鐵未提出有效的人員增補計畫，朱智宇提醒，「政府機關要增加人力可能比台鐵公司容易，儘管要經過行政院、立法院同意，但公司化後公司考量成本和營運的狀況下，很可能背離台鐵公司化是為了安全的初衷，產工不希望看到台鐵公司為了營利而犧牲掉安全。」