高端疫苗昨（10月31日）午間公布採購價，平均每劑價格含稅為840元，指揮中心稱此價比BNT和莫德納還低，並沒有買貴。對此，今（1）日衛福部長薛瑞元強調，稱高端不會買貴是所有本，對於外界質疑是套招，薛也說「我不知道所謂的套招是什麼」。
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鴻海永齡基金會、台積電和慈濟捐贈BNT疫苗，先前國民黨台北市議員徐巧芯指出，根據慈濟報告，花費約32.1億，購買506.9萬劑，平均每劑約630元左右。而高端昨公布採購價，平均每劑價格含稅為840元，兩者相差200多元。
對此，薛瑞元表示，鴻海永齡基金會、慈濟跟台積電採購捐贈的BNT，價格不會不一樣，不然可以向各個單位求證，實際BNT價格，因為衛福部是接受捐贈的，事實上不會理解他們合約價格，但是昨（10月31日）中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝稱高端不會買貴是所有本，因為包含政府自行採購的BNT等疫苗「是follow三家捐贈的採購價格」。
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薛瑞元解釋，保密協議是與高端簽約，「我們這邊叫做資訊的接收方，秘密資訊的接收方，那高端是秘密資訊的提供方」，保密協定是對接收方的拘束，並無拘束提供方，因此高端主動公布價格是沒有問題的。
針對高端自揭價格，遭外界懷疑是在套招救民進黨台北市長候選人陳時中選情，薛也回應這與套招沒什麼關係，高端要公布之前有知會，「我不知道所謂的套招是什麼」。