國民黨聲稱林智堅中華大學論文涉嫌抄襲，林智堅幕僚今（7）日強調，林智堅的論文相關時序相當清楚，早在科管局結案報告前完成，結案報告完成後該著作權才從中華大學讓予科管局，抄襲指控是有子虛烏有。
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首先，外界指控林智堅論文抄襲科管局，林智堅幕僚說明，林智堅2008年5月完成碩論，開始進行申請口試相關流程，並在同年6月26日完成口試，而科管局在同一天函文給中華大學，要求中華大學修正研究報告並7月5日前交付結案報告。
根據科管局與中華大學合約書內容，第14條權利及責任指出，中華大學在完成結案報告時，著作權才會移轉到科管局手上。
林智堅幕僚說明，因此，林智堅2008年6月26日口試時，他與中華大學研究團隊仍擁有該份報告的相關權利，並無抄襲之虞。
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第二，外界指控林智堅將碩論發表至其他研討會，林智堅幕僚指出，根據國科會研究人員倫理規範，第七條第A項指出，計畫成果報告通常不被視為正式發表，亦無自我引述之需要，研討會報告如該領域不被視為正式發表，亦無自我引述之必要。
此外，在第六條之D項指出，共同申請之研究計畫，皆可視為共同著作，而林智堅是該份報告的共同參加者擁有相關權利。因此，當林智堅在研討會發表該篇研究報告時，他擁有權利可修整並發表論文，並無一稿多投、自我抄襲的疑慮。