與保生大帝有關的傳說相當多，其中祂和宋代皇帝宋高宗的緣分更是家傳戶頌，故事發生在歷史上有名的「靖康之變」時期，北宋宋徽宗、宋欽宗和一眾皇族被金人擄走，北宋滅亡；而後康王趙構於南京應天府稱帝，是為宋高宗，史稱南宋。
中間神尊為保生大帝。（圖／記者連宜方攝）宋高宗即位之初，時局相當不穩，為了擺脫金人的追殺一路往南奔逃。可是慌亂之際，宋高宋竟和隨從侍衛走散，已經被金兵掌握行蹤的高宗一步步被逼近江邊，原以為無路可退，江邊卻突然出現了一隻馬，高宗二話不說跳上馬逃跑。
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在高宗跳上馬的同時，從天而降許多天兵天將，幫高宗阻擋了後方金兵的追擊，擺脫金兵的高宗，乘著馬到了一座古廟前，又黑又冷的夜晚，疲累的高宗顧不得其它，趕緊進廟找地方席地而睡。隔天一早醒來，高宗擔心金兵追上，想要騎上馬兒繼續趕路，在廟門前卻怎麼都找不到昨晚的馬。
後來在古廟內的走廊看到一匹泥塑的馬跟昨晚自己騎的馬一模一樣，高宗再看向神壇上的保生大帝，金身竟然在滴水，高宗才確認昨晚應該就是祂到江邊出手相救，馬和天兵天將都是保生大帝所派。後在紹興21年（1151），宋高宗下詔命令地方官在保生大帝的故鄉立廟，即為後來的青礁慈濟宮，高宗後每一任皇帝都對保生大帝再加封賞，可見其在宋代的地位之高、影響力之大。（編輯：連宜方）