台灣正遭逢新冠肺炎反撲，全國防疫警戒三級，網路媒體今日新聞連續3天進行網路民調，詢問民眾認為台灣24個縣市首長在這波疫情中的表現誰最好?台南市長黃偉哲以台南六都確診最低、最早啟動紓困振興等因素，至今天上午九時，獲得22.02％的支持度，領先全國各縣市。
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新冠肺炎從前年在中國大陸火速傳播至全世界時，台南市長黃偉哲就非常謹慎，台南市政府在當就成立COVID-19一級指揮中心會議，黃偉哲擔任指揮官，台南市政府各局處首長每兩周都要參加會議，目前已經舉行第40次的疫情會議，隨時掌握新冠肺炎的疫情。
台灣此波疫情對各行各業，均造成一定程度的影響，台南市長黃偉哲早在台北疫情爆發時，就指示各局處依中央規定執行紓困減稅，目前已有台南市觀旅局、經發局、教育局、交通局等單位，共提出20案，合計向中央爭取433億1790萬元補助款，加上台南市政府的經費2128萬元，總計433億3918萬元。
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自從台南市進入三級警戒後，台南市長黃偉哲也指示經發局，全力協助增加營業場所實聯制QR-CODE的建置，統計至5月24日止，台南市7家百貨公司均已使用政院版簡訊實聯制；台南市四大超商所屬815家在台南市據點，也都使用政院版簡訊實聯制；台南市179家大賣場，也都實施實聯制。
台南市政府因為高度重視此波新冠肺炎疫情，雖此次也遭到波及有8位民眾確診，但因高度掌握疫情，確診民眾都能溯源頭找到來自台北市萬華區的接觸史，迅速隔離相關民眾。