小琉球肚仔坪潮間帶原具有豐富的海洋底棲生物多樣性及獨特的海草床與珊瑚礁景觀，但已嚴重退化到海膽和滿佈坑洞的裸露礁石現況，針對可能因素，屏東縣政府透過中山大學團隊與在地導覽員頻繁溝通後，在兼顧當地觀光利益前提下，限制進入潮間帶的人數、劃設保育區復育生物、導覽限縮踩踏範圍、加強宣導並限制採捕海膽。
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▲小琉球肚仔坪潮間帶滿佈坑洞海膽啃食礁岩情形。（圖／國立中山大學研究團隊提供, 2021.01.25）屏東縣政府於109年委託中山大學研究團隊進行生態調查結果卻顯示，和五年前資料相比，肚仔坪不僅生物個體密度減少達八成，物種豐富度也下降超過八成，部分生物逐漸消失，生態環境也改變，急需研議解決方案。
近年來潮間帶礁台環境明顯改變，泰來草叢只零星可見，早期的優勢生物也已消失，取而代之的是數量龐大的海膽和為數也不少的海參。依現場勘查及影像分析，初估當地的海膽數量可能在80至100萬顆的驚人數字。
▲屏東縣政府於109年委託中山大學研究團隊進行生態調查結果卻顯示，肚仔坪不僅生物個體密度減少達八成，部分生物逐漸消失，生態環境也改變，急需研議解決方案。（圖／國立中山大學研究團隊提供, 2021.01.25）海膽在珊瑚礁生態系中扮演重要的角色，適量地啃食藻類，可以讓珊瑚有更多生長空間，其他底棲生物也可以躲在由海膽挖出來的洞穴中，並增加海參的食物來源。
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然而一旦海膽族群成長失控，原本豐富多樣的棲地就會因高密度海膽的啃食而改變，依存在其中的海洋生物也會隨之消失，最後只剩礁岩及海膽，這種狀態科學界稱為「海膽荒礁」，若再不處理，很可能會演變成毫無生氣的冰冷礁石。
▲小琉球肚仔坪潮間帶泰來草床遭遊客踩踏破壞棲地。（圖／國立中山大學研究團隊提供, 2021.01.25）中山大學研究團隊推測造成這個棲地退化及生物多樣性下降的主因，包括遊客踩踏破壞棲地、過漁造成海膽天敵減少、污水外溢造成海膽食物增生，以及大自然的颱風、氣候變遷影響等。