根據媒體今（16）日爆料，由中國大陸的「中國教育圖書進出口有限公司」架設的「台灣學術文獻數據庫」擅自修改台灣的碩博士生論文，只要標題提及「我國」便一律改為「台灣」，有矮化國格與造成國際混亂、誤解之虞。對此，教育部今日強硬回應，學術論文不容被刻意矮化我國家主權地位或侵害學校及師生權益，將要求大專校院檢視所授權之資料庫業者，如有不當運用情形，必要時應中止授權！
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中共國企中國教育圖書進出口有限公司爆出對我國論文進行審查，在其網站刪改論文的標題與摘要，再次引爆兩岸學術交流爭議，其中台灣論文資料庫業者華藝數位股份有限公司，就是透過中國教育圖書進出口有限公司獨家銷售代理，將論文資料庫販售給中國各大學或研究機構使用，但不只標題提到「我國」便一律改為「台灣」，部分論文中標題「國家」也改為「台灣」甚至「國立」兩字也遭到刪除。
教育部表示，有關我國博碩士學位論文遭資料庫業者配合中國大陸政治審查竄改內容，嚴重侵害我國學術研究成果一事，教育部重申學術論文不容被刻意矮化我國家主權地位或侵害學校及師生權益，將要求大專校院檢視所授權之資料庫業者，如有不當運用情形，必要時應中止授權，並提醒學生如發現論文被不當運用有逾越授權規範情形，除得中止授權外，也能要求賠償。另教育部也將提供授權的定型化契約，並與相關部會共同商定處理原則，避免再發生類似情形。
教育部說明，在11月接獲檢舉後，已邀集學者專家召開會議討論，將透過相關措施來維護國家尊嚴，並保障學校及師生權益，包含教育部會要求各大專校院檢視所授權之資料庫業者，如有矮化我國家主權地位或其他不當運用情形，應立即要求業者改善，如未改善，應中止授權關係。
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教育部也提醒學生，如發現論文授權予學校，含再授權予資料庫業者有逾越授權規範之不當運用情形時，除可隨時中止該授權外，並得視著作權受侵害，要求賠償。教育部已邀集智慧財產領域之學者專家討論授權予資料庫業者授權書內涵之合理性，並將擬訂定型化契約範本提供學校師生參考使用，避免論文授權被矮化或不當使用。
教育部針對特定民間資料庫業者的商業行為，是否確有配合中國大陸言論審查擅改論文內容等違反著作權法情事、矮化我國家主權地位或違反兩岸人民關係條例相關規定，會邀請經濟部、智財局及陸委會共同商定處理原則，避免類似情形發生。