駐美國代表處於11月24日傳出2名人員確診新冠肺炎（COVID-19），外交部表示患者目前均已居家隔離。駐美代表處也已經安排與2名患者有接觸的人員，全接受檢測，並自主隔離14天及進行遠距辦公。
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不過因為經濟部政務次長陳正祺，曾率團出席「台美經濟繁榮夥伴對話」，外交部特別說明，2名代表處確診人員都沒有和代表團有任何接觸。
駐美代表處也貼出公告，為維護同仁及公眾健康，代表處已進行辦公區域消毒作業，並要求同仁持續全程佩戴口罩上班，另在不影響公務下，進行分組輪流上班。至領務服務部分，由於確診同仁在不同樓層工作，也未與領務經辦同仁接觸，因此駐處仍維持現有服務，領務櫃檯仍保持每週一、三、五上午開放。