充滿爭議、延宕多時的澎湖小巨蛋，在工務處的努力之下已接近完工，不過因鄰近住宅區有許多大樹，雖未達百年珍貴老樹標準而面臨砍伐移除的命運，讓植樹不易的澎湖縣保育人士相當難過，當地居民籲請「刀下留樹」，澎湖縣政府教育處則從善如流，並將原規劃的停車場移往原來網球場位置。
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澎湖多功能綜合體育館〈小巨蛋〉已接近完工，不過在16日卻傳出因聯外道路需求，周遭許多茂密的大樹遭到砍伐的命運，引發鄰近居民強烈不滿，他們向縣府反應，澎湖植樹不易，少數單位卻執意破壞綠樹成蔭的美景；工務處說明，有少數針葉林種無法移植，才會忍痛予以砍伐。
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▲澎湖小巨蛋旁樹種為木麻黃、南洋杉等，因年代久遠早已蔚然成林，附近住宅區民眾看見陪伴多年的綠樹倒下，感到相當難過。（圖／記者張塵攝，2020.05.16）據了解，澎湖小巨蛋的聯外道路拓寬工程，會將路旁兩側樹木砍伐，由於樹種為木麻黃、南洋杉等，因年代久遠早已蔚然成林，附近住宅區民眾看見陪伴多年的綠樹倒下，感到相當難過。一位黃姓公所退休人員表示，根據工務處規畫該道路是條斷頭路，拓寬後只是方便前來運動的民眾，並無實質交通效益，驟然將大樹砍掉似乎不符合比例原則。
澎湖縣政府工務處說明，遭到砍伐的樹木都是無法移植的針葉林樹種，包括木麻黃、南洋杉等，至於3棵榕樹則遷移其他地方繼續生長，施工單位已盡量避開路旁樹木進行往南偏移規劃；而住戶質疑的交通機能與使用效益問題，當初設計提供給馬公國中學生、體育館及鄰近居民使用。