蘇貞昌內閣今（14）日依照憲政慣例總辭，在舉行完最後一次行政院院會後拍攝畢業照。除了國發會主委陳美伶證實將去職之外，也傳出文化部長鄭麗君、科技部長陳良基將不留任，有意返回教職的陳良基透過臉書表示「感謝給我擔任公僕的機會」，他已向蘇貞昌再次表達交棒的心意。
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上午全體閣員拍攝畢業照，合照完後，陳良基接受媒體訪問時僅說，去留還是讓院長來宣布比較好，而他自己借調到5月19日。隨後不久，陳良基就在臉書上說，今日在行政院簽署總辭公文書，心裡充滿感恩之心。讀一輩子書，常講書生報國，感謝有整整四年時間擔任公僕，以自己的專業，報效國家，服務社會。總辭前院長再次懇談，他也再次表達交棒之心意，非常謝謝讓他加入行政團隊服務眾人。
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陳良基說，科技興國，仍是立國興國最根本之道，也是讓國家得以創造出更高價值的基本能力。感謝國人對科技的支持，也感謝所有科學團隊、研究機構、科技產業，大家共同費心投入，我們能有護國神山、有護國產業，我們用科學和技術，為台灣建立起堅強的科技屏障。我們更用科技協助防疫，用科學挺住抗疫前線，讓台灣的防疫驕傲成為世界矚目的焦點。
陳良基表示，「以終為始、勿忘初衷」，是掛在他辦公室唯一的字帖，四年來催促著他，掌握大方向，全力以赴。他把每天都當成人生最後一天的拚勁，燃燒自己，為打造台灣成為優質有競爭力的科研環境以及科技產業發展沃土，全力衝刺。他要衷心感謝跟著他一路勞心勞力的工作夥伴們，非常謝謝夥伴們。如果說，這些年來，在科學、技術、甚至教育的各項政策推動上，有任何成績，都是團隊共同齊心努力所致，感謝大家。