針對敦睦艦隊集體感染新冠肺炎疫情一事，繼昨（21）日國防部發表首波懲處名單後，總統蔡英文今（22）日發表敞廳談話，她指出：「我是三軍統帥，國軍的事就是我的責任。」「海軍這次任務出了這麼大的違失，讓國人因此承擔疫情風險，我要致上我的歉意。」蔡英文強調，待疫調及相關責任釐清後，決不會護短。
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蔡英文表示，目前最重要是確保整體國軍防疫與疫調工作，應用最高標準儘速進行；而在當前台海情勢下，她也要求國軍絕不能因為本案，影響國軍日常的戰力整備和國家安全的維護任務。在初步的調查中，國防部已整理出四大缺失，部長也將主責的將領調離現職。本案應持續調查，釐清問題癥結，並將調查的階段結果隨時向社會說明，待完整調查後進行相關人員的懲處。
她進一步指出，她要求國軍的就是，保衛國家、保衛人民，一刻不得鬆懈，尤其是台海當前情勢，對岸軍事動作頻繁，疫情期間必須的戰備演訓仍須進行，保持正常的戰力及戰備。
蔡英文說：「國軍擔任第一線守護國家的大任，國人高度期待，我要求國軍堅守崗位，也請國人給予國軍支持與鼓勵，並且讓國防部有時間檢討、處置，國家安全及防疫工作都是重中之重，政府團隊要繼續努力，也要謝謝全民的合作，我們一起加油！」
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至於後續調查報告提出是否有時間表？蔡英文表示，當然國人都希望能在最短時間內，提出最完整的調查報告，但目前疫調正在進行中，且也需要給予當事人陳述機會，目前當事人仍在隔離中，因此她已責任國防部盡速提出完整調查報告。
對於民進黨立委表示敦睦艦隊此行有機密任務一事，蔡英文表示，有些細節不方便透露，但若問及此行艦隊有沒有去帛琉以外的地方，她堅定地回答：「沒有。」