磐石艦27人確診引發國人恐慌，海軍說法一日三變，讓國防部成為眾矢之的。國防部在今（21）日晚間8點30分公布懲處名單。國防部長嚴德發帶領國防部高階將領鞠躬向社會大眾，以及染疫官兵、家屬道歉；嚴德發指出敦睦艦隊的出航是自己做的決定，也曾向蔡英文總統報告，總統基於尊重，以予同意，但防疫應該做好更嚴密的準備，卻造成疏失，為此已向蔡英文總統自請處分，也表示後續會全力配合中央流行疫情指揮中心的疫調。
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嚴德發也指出國防部在敦睦艦染疫事件的四項缺失，包含疫情通報不夠落實、回來之後聯檢小組沒落實實質檢疫、任務執行期間，官士兵防疫管理方面不夠確實、海軍之前相關的防疫措施規劃不足。