針對海軍敦睦艦隊確診案例飆升，國防部對於疫情的說法一變再變，立法委員萬美玲表示為避免防疫出現破口，確診官兵進行疫調時，如有涉足不當場所，為鼓勵誠實說出足跡，應該予以免責。此外也應設立吹哨者保護制度，鼓勵艦隊官兵說出實情，避免高官隱匿案情。
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萬美玲說防疫應重於一切，對於目前敦睦艦隊確診官兵是否都有「誠實」說出其足跡，確實令人存疑，因為這些確診的官兵如果有涉足不當場所，有可能會因為擔心遭到部隊懲處，所以選擇隱匿部分足跡，這就有造成疫調的不完整，形成防疫上的破口，因此建議國防部，如確診官兵在進行疫調時，誠實說出有涉足不當場所時，應予以免責，畢竟防疫才是當前最重要的事。
萬美玲指出，現在海軍對外用擠牙膏式的說明，已經讓人質疑有隱匿之嫌，但相信一定有知道實情的艦隊官兵存在，只是因為害怕被秋後算帳所以不敢舉報長官，所以吹哨者保障條款的設立是一定要有的，這樣才能避免高官隱匿案情，並讓艦隊官兵敢勇於舉報，讓事實可以早點水落石出。