中央流行疫情指揮中心已將全球多國列為第三級（警告）疫區。我國許多外館所在地身陷疫區，外交部18日晚表示，為超前布署、妥善因應，外交部已通電駐外各館處依下列原則因處疫情變化。
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外交部發言人歐江安指出，授權相關駐外各館處視情遠距辦公，以分組、分流為原則，擬定相關應處計畫，並確切落實代理制度，對外辦公時間仍維持不變。倘遠距辦公則需將工作內容記錄於工作日誌，並使用符合資訊安全的通訊設備，以確保指揮體系、對外通訊及駐館與外交部總部的通聯運作正常。
外交部表示，另請駐館同仁落實個人防護措施、避免出入高風險公共場所，以及每日量測體溫。另針對分組輪值人員，要求交接前後落實交接物品消毒清潔。倘有發燒等不適症狀，請同仁居家隔離14天，並即聯繫當地衛生單位續處。同時請各相關館處依據駐地情況彈性應處，以維持館處核心運作及維護同仁眷屬健康，避免感染。
外交部將持續密切關注全球疫情發展。除電告相關外館上述處理原則外，並請相關外館參考主要國家駐當地使領館作法，評估業務推動及必要性，並決定是否實施居家彈性辦公。實施前外交部及相關駐館將妥為對外公告，避免影響領務業務及國人服務。
中央流行疫情指揮中心17日最新疫情記者會上，媒體詢問歐洲疫情嚴峻，我國是否會提供外館防疫物資，如果駐外人員染病，是否會提供協助後送回台？疫情指揮中心指揮官陳時中表示，外交人員是我國對外聯繫窗口，當然會提供防疫物資，予以保護。
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※【
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因應武漢肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，國外入境後如有發燒、咳嗽等不適症狀，請撥打「
1922」專線，或「
0800-001922」，並依指示配戴口罩儘速就醫，同時主動告知醫師旅遊史及接觸史，以利及時診斷及通報。