行政院於 12 日核定「交通部對受嚴重特殊傳染性肺炎影響發生營運困難產業事業紓困振興辦法」，針對民航業訂有多項優惠補貼措施，將回朔2月1日起開始實施，為期一年，地勤業、空廚業也同樣對其房屋使用費、土地使用費等給予補貼；機場餐飲賣店、免稅商店也會補貼辦法，協助維持營運。
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交通部表示，本次武漢肺炎疫情有別於 SARS ，對國際航線之衝擊大於國內航線，國際航線運量於 2 月份已減少約 50% ，確實有協助紓困的需要，為了解業者需求，已與航空業者座談，並將業者反映意見納入紓困辦法內容。
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針對民航業，交通部提出優惠補貼措施，包括對飛航國內、國際及兩岸航班的民用航空運輸業補貼其降落費、房屋使用費、土地使用費、維護機庫使用費、飛機修護棚廠使用費，自 2 月 1 日起開始實施，為期一年；地勤業、空廚業也同樣對其房屋使用費、土地使用費等給予補貼，另對民用航空運輸業維持正常營運資金之融通貸款利息，以及民用航空運輸業及地勤業配合執行防疫措施所需費用亦均給予補貼，同時將將緩收業者相關費用 4 個月，未來視疫情狀況，有需要將再延長實施。
此外，交通部針對機場餐飲賣店、免稅商店、一般商店、商業廣告等業者主要之營運成本，包括房屋使用費、土地使用費、權利金提出極為優惠的補貼辦法，並追溯自 2 月 1 日起開始實施，為期一年。為進一步協助業者，機場公司及民航局並宣布將緩收業者相關費用 4 個月，希望全力協助機場業者共渡疫情難關，待疫情過後及早恢復榮景。