武漢肺炎疫情持續延燒，行政院長蘇貞昌今（27）日於院會上宣布指揮中心升級為一級開設，但指揮官仍然是陳時中，到底升級為「一級開設」差別為何？指揮官陳時中表示，是針對國內、國際疫情的進展而升級，一級開設後加強方向為3大面向，含為強化橫向聯繫、中央與地方合作、醫院加強部屬。
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陳時中指出，因為現在已經出現像第23例，沒有辦法追蹤到感染的來源的狀況，加上看到國外疫情發展的情況，因此要超前部署，開設了之後除了感謝感謝行政院肯定自己，續任為指揮官，但也要靠各部會首長的通力合作，目前為止溝通良好。
對醫院端檢測能力上，也會有所不同，指揮中心執行官周志浩表示，鑑測能力是量能上的持續擴充，原先只有3個實驗室，每天檢測500例，現在也已經提升為每天1千多件、27間實驗室可以進行檢驗，下一個階段努力的範圍是提升每間實驗室的檢驗量，希望到月底達成每日2千餘件。
陳時中強調，升級為一級開設並非是「3級跳」，而是持續觀察升級後行政院認為現在有必要所以升級，而在民眾端則是沒有不同，防疫的措施沒有因此改變，而在一級開設裡面，指揮官還是在行政院長的授權下辦理業務，而在各個部會間的合作，就是和疫情有相關的就會報到部內一同進行討論。
周志浩說，一級開設要做的事情非常的多，無論是國際疫情越來越嚴重，或是社區感染的壓力也是越來越大，因此需要有更前瞻的部署，現在應該要準備要企業知道應該要準備什麼事情、加入藥物研發的速度甚至與民間結合，研發快篩試劑等事宜。
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台灣自1月21日起，發現首位境外移入個案，雖符合第二級開設定義，但當時認為個案是在登機檢疫攔查直接後送，未進入社區，繼續維持三級，直到武漢1月23日封城，宣布防疫等級升級至二級開設，主責單位由疾管署提升至衛福部，陳時中擔任指揮官。
1月28日我國第5例確診個案丈夫，未出國卻遭確診妻子感染，雖出現本土感染者，但由於屬於家庭群聚，暫時不提升防疫等級，當時陳時中表示，若出現社區內密集感染，無法掌握感染來源，將啟動一級防疫層級。而目前第23例還未找到感染來源。