受到武漢肺炎影響，除了兩岸及港澳航線大量取消之外，其他國際航線也因疫情減班，星宇航空宣布， 2 月 24 日至 3 月 31 日取消部分峴港航班，日本航空、華信航空、台灣虎航日本航線也有調整，其他像是新加坡、越南、韓國等航線也都有影響，旅客可向各航空公司辦理退票或改期，並享有免手續費服務。
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星宇航空表示，因應武漢肺炎影響， 2 月 24 日至 3 月 31 日台北往返峴港的 JX1701 、 JX1702 取消，將協助受到影響的旅客後續改票或退票事宜，原本的 JX701 、 JX702 仍維持正常每日一班服務。
同樣受到武漢肺炎影響，日本航空公告，將針對台北－大阪航線進行減班， JL814 、 JL815 自 3 月 5 日至 21 日從每周 7 班改為每周 4 班；華信航空台中往返東京、沖繩、胡志明市部分航班取消；台灣虎航台北往返東京、大阪、沖繩航班取消，旅客可詢問航空公司進行改票或退票作業，將不收取手續費。
此外，因韓國將台灣提升旅遊警示導致觀光人數大減，易斯達航空已停飛仁川、釜山飛往花蓮的包機至 3 月 28 日，另外也自 2 月 16 日起停飛台北往返釜山、濟州、清州，及高雄往返仁川航線；釜山航空也取消 2 月 16 日至 3 月 28 日台北往返釜山、大邱，及高雄往返釜山、仁川部分航線。
濟州航空則是自 2 月 11 日至 3 月 28 日取消部分台北往返仁川、釜山、大邱、清州、務安，及高雄往返仁川航線；德威航空自 2 月 11 日至 3 月 28 日部分台北－大邱、台中－仁川、台中－釜山、高雄－仁川、高雄－釜山航班。
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江源航空公告， 3 月 1 日至 28 日台北－襄陽取消；大韓航空 2 月 21 日至 3 月 19 日台北往返釜山的 KE697 、 KE698 取消；韓亞航空取消台中－仁川 2 月 19 日及 2 月 26 日至 3 月 15 日 OZ7117 、 OZ7127 航班，以及部分高雄－仁川航班；國泰航空也取消 3 月 28 日前台北往返仁川的航班。
業者提醒，受影響旅客可向各航空公司官網提出退費或改票申請，將不收取手續費，若是向旅行社或其他第三方平台，則須向購票方提出申請。