新型冠狀病毒疫情持續擴大，包含台灣在內，世界各國陸續暫停中國大陸以及港澳航點，樂桃航空也宣布，即日起至 3 月 28 日止，暫停日本飛往上海、香港的大部分航線，僅剩每日一班次大阪往返香港航線正常營運。
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世界各國陸續暫停中國大陸以及港澳航點，全日空與日本航空日前宣布， 3 月 28 日前暫停香港、北京、上海等大城市航點，另外像捷星航空成田－上海、春秋航空成田－武漢也是暫停營運。
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樂桃航空繼之前宣布停飛東京、大阪往返上海的航線外，再宣布 2 月 17 日至 3 月 28 日擴大停飛大阪、沖繩往返香港的部分航線，僅剩每日一班次大阪往返香港航線正常營運，目前樂桃航空已向日本國土交通省作出營運計畫更改的申請。
樂桃航空表示，受影響顧客可於官網自行申請退票，或是可自行申請轉乘同一航線的其他替代航班（出發日期為 4 月 20 日之前），不用支付手續費，但無法安排更換其他航空公司的航班、或承擔乘客因改乘其他交通工具而產生之費用的賠償，也無法補償因停航而產生之目的地住宿費、租車費用等。