菲律賓民航局宣布因應武漢肺炎疫情，禁止台灣人入境菲國，導致我國人原班機被遣返，外交部發言人歐江安11日表示，這是因為菲律賓政府有不同的系統，但菲律賓駐台機構（MECO）與菲國總統府已經向我方澄清，指菲國民航局的管制不是「官方立場」，對於菲國內部訊息的混淆向我方致歉，目前正在洽商中。
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歐江安說，外交部昨天下午已經接洽MECO，對方澄清這不是官方立場。但是菲律賓民航局卻片面公告禁止台人入境，這是因為菲律賓衛生部依據WHO「一中原則」告知菲國民航局執行的關係，但MECO已經向我方證實，指出這不是官方立場，對於菲律賓內部的訊息混淆，向我方致歉。
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歐江安強調，這是因為菲律賓政府內部有不同系統的關係，MECO已經向我方保證，且透過菲國總統府，表達了菲國官方的正式說法。外交部對於部分國人被迫搭乘原班機返國感到遺憾，我方正積極向菲國溝通與交涉中，強調「我方並非中國，也非疫區，且我方掌控疫情良好」，菲律賓應更正管制做法。