武漢台胞第一批包機回台，傳出旅客名單遭人調整引發爭議，國民黨５日澄清，指出黨沒有介入旅客名單等細節，相關細節都由官方處理；至於黨員徐正文召開記者會，屬於個人言行，如果他涉及干擾政府防疫工作，黨中央不排除黨紀處理。
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國民黨文傳會代理主委王育敏表示，國民黨考量到兩岸之間的溝通僵局，導致台商滯留中國大陸無法順利返台，因此於春節期間成立「七人小組」從旁積極協助，促成武漢台商第一次包機回台，關於後續旅客名單等具體事宜，都由陸委會、國台辦，以及海基會、海協會持續溝通和討論，國民黨並未介入其中。
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國民黨指出，防疫當前，國民黨的立場是「不分朝野、一起防疫」，如何在台胞人權與防疫之間取得平衡，是這次協助包機事件的重點。徐正文對此事件的言行，和主動發布第二次包機時間有誤，都屬於徐正文的個人行為，與國民黨無關。
國民黨呼籲，不希望有任何台商或黨員發表意見造成防疫工作的負面影響，也請相關人士自我節制，對於後續包機回台規畫，國民黨尊重陸委會的職權。國民黨強調，防疫當前，任何人都不應干擾防疫作業進行，或發佈不實訊息，如果發現有黨員的個人言行干擾防疫工作，不排除祭出黨紀處分。