選舉對於澎湖離島居民來說是辛苦的，許多住在台灣，甚至在大陸、越南經商的澎湖人，常需要舟車勞頓才能返鄉投票。2020總統立委大選投開票日，澎湖119個投開票秩序相當良好，平均花不到2分鐘就完成投票，不過西衛投開票所因為澎科大學生而大排長龍，一早南海碼頭也湧現回望安、七美、虎井投票的人潮。
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▲今年選舉日剛好是學校剛放寒假，澎科大學生想盡早投完票回家過年，一大早就開始到西衛里活動中心排隊，人龍長達數百公尺，景象相當壯觀。（圖／記者張塵攝，2020.01.11）澎湖科技大學的學生因為離島居民搭機7折的優惠政策，因此只要考上大多會將戶籍遷到澎湖，所以創下全國單一最大戶1600多人的紀錄，每次選舉這裡幾乎就是兵家必爭之地。今年選舉日剛好是學校剛放寒假，學生想盡早投完票回家過年，一大早就開始到西衛里活動中心排隊，人龍長達數百公尺，景象相當壯觀。
▲陳姓民眾在高雄30年了，但是澎湖子弟心繫家鄉的心情不變，上午在機場候捕最後一位趕上飛機，等會投完票還要搭機回高雄。（圖／記者張塵攝，2020.01.11）澎湖縣有人居住的大小離島多達19個，一早在南海、北海碼頭聚集許多返鄉投票的人潮，將候船室擠得水洩不通，加上今天氣候晴朗舒適，離島民眾把投票當作每年一度的同鄉會，大家噓寒問暖場面熱絡。今日交通船幾乎班班客滿，虎井的船隻隨到隨開，畫面中陳姓民眾搬到高雄30年了，但是澎湖子弟心繫家鄉的心不變，上午在機場候捕最後一位趕上飛機，等一下投完票還要搭機回高雄。
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藍營立委候選人歐中慨上午9時，在鎖港投開票所完成投票；綠營立委候選人楊曜，則是下午3時在東甲廟投票；澎湖縣長賴峰偉偕同夫人郭美珍，則是一早在住家對面文國中投開票所完成投票，並呼籲民眾選賢與能，珍惜手中寶貴的一票，決定台灣未來的走向。
第15任總統副總統及第10屆立法委員選舉，澎湖全縣共計設置119個投開票所，總統選舉人人數為88,432人，立委選舉部分，不分區選舉人數為88,441人、區域87,287人、平地原住民235人、山地原住民234人。投票時間自上午8時起至下午4時止。