由於婦聯會拒簽行政契約，內政部106年底撤換婦聯會主委辜嚴倬雲。辜嚴倬雲與婦聯會不服分別興訟，日前向台北高等行政法院提起訴訟，法院審酌二案事實相同，今（26）日合併宣判，判決辜嚴倬雲及婦聯會敗訴，仍可上訴。內政部對此表示，行政法院的判決，正是肯認主管機關應有的作為。
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內政部表示，為瞭解並釐清婦聯會的資產來源與勞軍捐關聯，自105年3月起即請婦聯會提供相關資料並作說明，婦聯會拒不配合，故於105年7月6日依人民團體法第58條規定給予警告處分，並再多次限期提出相關佐證資料，但婦聯會仍未配合提供，內政部續依人民團體法同條規定，撤免婦聯會正、副主任委員辜嚴倬雲及葉金鳳之職務。
婦聯會及辜嚴倬雲對於撤免職員的行政處分不服，均提起訴願，經行政院分別駁回婦聯會之訴願及裁定不受理辜嚴倬雲之訴願，婦聯會及辜嚴倬雲不服訴願決定，續向台北高等行政法院提起行政訴訟，台北高等行政法院基於訴訟經濟考量，將2件行政訴訟案合併開庭處理，自今年1月至11月間召開6次準備程序、1次言詞辯論庭。
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內政部指出，婦聯會於107年12月24日即選出新任主任委員雷倩，會務順利運作至今，且今年10月14日辜嚴倬雲於報紙頭版刊登聲明啟事，表示因年事已高，健康狀況不佳，且已卸任婦聯會主任委員，早已不參與婦聯會之事務。台北高等行政法院的判決，正是肯認內政部為政治團體主管機關之應有作為。
內政部強調，按政黨法第43條第2項規定，政治團體應於政黨法施行後2年內，也就是在今年12月7日前完成章程修正轉換為政黨。婦聯會10月時召開會員代表大會，決議不轉型為政黨，由於政黨審議會已經做出決議給予政黨4個月的補正期限，內政部也將比照政黨，同樣給婦聯會4個月的轉換期，如果婦聯會仍未在期限內轉換，將依法廢止立案。