108年11月15日開始，台南市所屬國小、國中、高中／職、五專一至三年級學生，均已陸續安排醫療團隊入校園，為學生接種公費流感疫苗，校園學生在校接種公費流感疫苗好處多，包括擁有專業醫療團隊到校服務；流感季擁有保護力；節省父母時間及金錢；降低感染流感併發重症機會；避免傳染給家中老人跟幼童，讓民眾健康更有保障。
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11月15日公費四價流感疫苗首批接種對象為校園學生及醫事人員，本次公費四價流感疫苗全面升級（包含A型的H1N1及H3N2、B型的山形株及維多利亞株，採2A2B型別），因流感病毒易侵襲學童及青少年引起校園群聚，在流感流行期亦常見學生因病缺勤或停課的情況，且經研究發現針對學生集中接種流感疫苗，可降低社區整體流感疫情與家中其他孩童的流感嚴重度，透過校園接種間接保護其他高風險族群。
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台南市長黃偉哲呼籲，校園學生在校接種流感疫苗，保護自己也保護家人，接種流感疫苗後需兩週達良好疫苗保護力，在此期間提醒民眾平時應落實勤洗手、有呼吸道症狀時應配戴口罩，儘量避免出入人潮擁擠、空氣不流通的公共場所；打噴嚏時用面紙或手帕遮住口鼻，或用衣袖代替；與他人交談時，儘可能保持1公尺以上，防範病毒傳播。
流感疫苗相關資訊可至台南市政府衛生局「衛生安全-流感疫苗及肺鏈疫苗專區-流感疫苗相關資料」查詢；若有任何流感疫苗相關問題，可撥打專線洽詢。