國家機密保護法修正後，中科院遭民進黨立委趙天麟爆料自行下架涉密境管人員資料，經移民署重新上線後調查發現，涉密離境人員有15人前往香港、3人前往柬埔寨。國防部28日表示，遵立法院外交及國防委員會有關「加強中科院境管措施」及「涉及國家安全及機密人員經香港或澳門轉機存有風險，應予研修」之決議，將研擬修正作法及採取相關措施。
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國防部表示，依據立法院外交國防委員會召委趙天麟於10月16日提案，並經委員會決議，國防部及中科院分別訂定「從事國防事務現職及退離職人員申請進入大陸地區作業規定」及「中科院赴陸管制作業規定」，其中對於申請進入香港或澳門地區，及相關轉機管制，應訂定更為嚴謹之規範，以確保機密維護及從事國防事務人員安全。
國防部強調，將依立法院指導，審慎納入法令修正，並監督中科院配合辦理，以周延港澳過境審查之機制。