前國防部副部長陳永康擔任韓國瑜陣營的國政顧問，但是傳出陳永康先前在中科院任職的秘書遭解雇，韓國瑜國政顧問團總召張善政怒批是「綠色恐怖」。中科院對此表示，員工資遣無關政治考量，絕對沒有綠色恐怖情事發生。
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媒體報導，張善政昨（6）日表示，在公布首波國政顧問名單後，陳永康先前擔任中科院董事時的許姓秘書遭到解職，張善政質疑民進黨政府在搞「綠色恐怖」。
中科院回應表示，員工資遣無關政治考量，許姓員工於2016年9月經招考任職中科院科技聘雇人員，於同年10月經本人同意後，辦理職類轉換，擔任陳永康專任秘書。
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中科院指出，陳永康日前自請辭職，中科院經檢討許姓秘書原科技職缺，於3年前就已經補人，又因為中科院內並無適當職缺可供安置，因此才依勞基法相關規定，完成資遣費發放資遣。
中科院表示，中科院為台灣國防安全的重要戰略資產，除重視優質的科研人力，並保障員工的合法權益，行政作業均秉行政中立為原則，絕無媒體所述「綠色恐怖」情事發生。