時代力量立委黃國昌踢爆，國安特勤人員利用總統通關禮遇走私 9,800 條香菸入境，甚至直指有華航高層協助，痛斥華航董事長應下台負責。對此，交通部長林佳龍回應，已要求華航全面展開行政調查，所涉及的疏失及責任將究責無上限，並對歷年來可能涉及違法行為進行調查，釐清後會盡快對外說明。
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交通部長林佳龍表示，國安人員透過華航非法購買大量菸品，昨日已要求華航全面展開行政調查，也會配合檢調單位偵辦，務必釐清疏失及責任，同時要求華航針對歷年來狀況進行釐清，證據到哪、責任到哪，涉及到的人就檢討到哪裡，疏失及責任將究責無上限，至於有沒有設定期限，林佳龍說「越快越好」。
針對外界質疑，華航自行展開行政調查是否有球員兼裁判之嫌？林佳龍指出，交通部會持續監督，也會有司法調查，行政調查也會將資訊透明，讓社會加以監督，這才是解決問題的態度。
外傳華航內部有不少是民進黨人士親信，走私案也可能與華航內部爭奪華航總經理一職有關，林佳龍澄清，人事跟這件事沒關係，這是多年來的陋習，華航到底在這裡面扮演什麼角色，走私是很嚴重的違法行葦，過去可以，不代表現在可以縱容，發現問題要勇於承擔責任，才可以獲得社會信任。
林佳龍強調，華航作為一家上市公司，也必須要加強內部自理，避免內控失靈，除了國安單位要負起責任外，交通部監督的華航部分，也會同步展開行政調查、釐清責任。
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