促進轉型正義委員會向國家安全局調閱與林宅血案、美麗島事件和陳文成命案等政治相關案件檔案，除林宅血案以外，其他被列為永久機密。對此民進黨籍立法委員段宜康今（ 8 ）日在司法及法制委員會怒批國安局，並希望總統府依權責解密這些檔案。
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段宜康指出，根據《國家機密保護法》規定，涉及國家安全情報來源或管道之國家機密，應永久保存。但是調查人員被安排潛伏在美麗島雜誌社，不涉及國家安全，因此這並非「國家安全情報來源」。國家安全是指對外情報，國安局要保護潛伏在國外的情報員需要列為機密。現場的法務部官員也認同，因為「國家機密保護法」主要著眼於國家安全，所以與國家安全、國家利益無關的，當然不在國家機密的範圍內。
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段宜康又指出，《國家機密保護法》第 5 條，「國家機密之核定，應於必要之最小範圍內為之」，核定國家機密不得違反「為隱瞞違法或行政疏失」，因此在陳文成命案中，如警備總部或國安局有涉及違法，不得因國家機密而隱瞞，核定國家機密也不得以掩飾不名譽行為為目的。
▲陳文成命案被國安局列為永久機密。（圖／截自陳文成基金會）段宜康痛批，這些案件的檔案，為什麼不可以讓大家知道？這些案件都是 30 多年前，如果一個國安局長可以核定列為永久機密，那根據《國家機密保護法》規定，原核定機關或其上級機關核定權責人員得依職權或依申請，就實際狀況解除機密。因此，國安局上級機關國安會有權能夠解除機密，而總統府第二局局長邱昌嶽則表示，任何國家機密的檔案都在檢討機密等級。