澎湖縣政府制訂馬糞海膽、澎湖特有種小章魚等稀有海洋物種的禁捕期之後，卻發生成效不彰數量卻越來越少的窘境，引發外界對保育政策強烈質疑；澎湖海洋生物研究中心主任謝恆毅呼籲主管機關，要拋棄「時間管制」觀念，改以「區域管制」的新作法，避免禁捕開放日成為海洋生物的「大屠殺」日。
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針對現行以時間來訂定禁捕期的方式，澎湖海生中心主任謝恆毅相當不以為然，已多次向澎湖縣政府建議，希望能以區域輪流管制為主，如此才能讓海洋資源得到真正的休養生息，可惜一直未獲澎湖縣政府採納。
▲澎湖特有種小章魚，清明節前會聚集在沿岸潮間帶準備交配產卵。（圖／澎湖縣農漁局提供，2019.03.21）研究澎湖特有種小章魚10餘年的海洋生物研究中心副研究員城振誠表示，澎湖小章魚受到氣候變遷影響，族群數量起起伏伏，最嚴重是在2008年澎湖大寒害後，平均漁民出海2次僅能捕撈到1隻，過了7、8年之後，因為人為因素又恢復到1次可以採捕到10幾隻小章魚。
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▲居民在潮間帶大量踩踏破壞的結果，可能加速附近海洋生態的滅劫。（圖／記者張塵攝，2019.03.21）產季在每年2至5月的澎湖特有種小章魚，清明節前小章魚會聚集在沿岸潮間帶準備交配產卵，由白沙岐頭、中屯至馬公重光里等海岸線潮間帶燈火通明，「夜照章魚」成為北海岸離島居民的日常，許多人頭戴照明燈投入捕撈行列；不過保育人士擔心，居民在潮間帶大量踩踏破壞的結果，可能加速附近海洋生態的滅劫。
▲澎湖特有種小章魚與馬糞海膽一樣，禁捕期拉長之後數量反而減少。（圖／澎湖縣農漁局提供，2019.03.21）澎湖特有種小章魚與馬糞海膽一樣，禁捕期拉長之後數量反而減少，在物以稀為貴的情況下，今年價格飆漲到每台斤1200元，而今年小章魚禁捕期由3月29日至4月12日止，但外界質疑小章魚前期還未交配就被捕捉，就像馬糞海膽一樣，每年7月1日開放就是屠殺日，各地海域族群同時被捕撈。