國民黨主席吳敦義日前表示，國民黨若重返執政，會與大陸洽簽「和平協議」。陸委會今天 （ 19日 ） 發出聲明指出，任何政黨執政，若將個人或政黨意志凌駕於民意之上，以主權作為籌碼，將導致危害主權、傷害民主的不可逆後果。
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陸委會強調，兩岸和平穩定發展，是政府一貫的主張，台灣也一直扮演穩定台海及區域和平的角色，但現階段兩岸要和平，就是中國大陸要放棄武力威脅，中共不放棄武力統一，再多協議也沒用。在北京當局不斷強加「一個中國」原則、「一國兩制」的政治框架於台灣的前提下，政府不主張洽簽任何消滅國家主權與台灣民主的政治性協議。
而針對兩岸間的任何政治性協議，政府已規劃建立一個強力的民主防衛機制，也就是蔡總統所說的「民主防護網」，以避免任何政黨執政，將個人或政黨意志凌駕在民意之上，以主權當作籌碼，導致危害主權、傷害民主的不可逆結果。
此外，為避免政治協議的簽署，陸委會聲明將就行政院所列優先法案中，修訂「台灣人民與大陸人民關係條例」，明訂進行兩岸和平協議前之公投條件與門檻。
陸委會指出，我們的規劃就是在兩岸人民關係條例中，建立相關的民主監督程序。也就是涉及政治議題的談判，必須由行政院提出談判計畫，立法院要有三分之二的委員同意才可以去談。
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兩岸政治性議題談完回來後，因為立法院有審議權，所以還要有四分之三的立法委員出席，四分之三同意，同意後公告，再進行全國性的公民投票，要全國選舉人數半數以上同意，才能通過。
陸委會認為，會有這麼高的門檻，最主要是涉及兩岸的政治議題，若社會沒有高度共識，會帶來更大的爭議與紛擾。