總統蔡英文元旦文告提及將讓收入較少民眾優先分享經濟成長紅利，擬推動類似負所得稅制，但這項政策宣布，也讓財政部有些難為，主要是負所得稅制推動難度高，有公平性的問題，過去面對「還稅於民」的訴求，財政部更堅稱稅收超徵與還稅於民是兩回事，多增加的稅收是要拿來還債或減少舉債，避免債留子孫，如今總統一句話希望能照顧經濟弱勢者，讓財政部也不得不開始研究，籌措財源。
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據了解，總統蔡英文要送出這個經濟紅利大禮時，財政部相關單位事前未接獲指令進行必要評估，不少官員還是看了報紙才知道，而面對後來媒體的詢問，財政部也僅強調，將盡速盤點各項財源，並在不舉債前提下推動相關措施，甚至在媒體要求說明到底是不是要「還稅於民」，財政部也僅發布簡短說明稿，看得出整個政策都是由府院在主導。
國立台北商業大學財政稅務系暨研究所教授黃耀輝認為，光從財政部的反應也可看出，財政部並不是很認同蔡總統的做法，因為過去4年稅收超徵，當初大家也誤以為財政改善，既然稅收比預算還要多，為何不還稅於民？但財政部都說財政沒改善，每年都赤字，每年都要增加舉債，所以債台高築，當然，還債有很重要的意義，現在還債可減經後代子孫的負擔，一直舉債花錢，只會讓後代子孫稅負越來越重。
不過，財政部認為近年因景氣回溫，稅課收入優於預期，2014年度至2017年中央政府總預算稅課收入決算數較預算數合計增加3652億元，用於減少債務舉借，這4年度合計減少舉債4627億元，有助健全財政。
財政部進一步表示，2018年中央政府總預算編列債務舉借1269億元，因歲入執行良好，目前未舉借，待執行預算所編債務還本792億元將可達實質減債效果，預估2018年度歲入歲出將有賸餘可供運用，惟賸餘金額須俟決算編定方能確定。
至於總統元旦文告談及將讓收入較少民眾優先分享經濟成長紅利，財政部則稱考量近年財政已有改善，乃運用部分資源照顧經濟弱勢等，但這與單純將超出預算數的稅收歸還民眾，是兩碼事。
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對於可能推動負所得稅制，財政部官員則認為推動難度高，除採用的國家不多，要獲得補助也有限制，所得低於一定水準以下，還必須先有勞動事實，還要申報綜所稅，還涉及公平性問題，主要是無法完全掌握攤販等職業的年度所得歸戶資料，難以判斷真正需要的對象，可能會讓政府照顧經濟弱勢的美意打折扣。
不過，畢竟是總統蔡英文欽點的經濟紅利政策，財政部除強調負所得稅制度是補貼低所得者，收入在一定所得之下，不用繳稅，還可領補貼，為公共支出，而非「還稅於民」，也只能依指示去做，並強調近期行政院將開會協調各部會研擬具體方案，財政部也將盡快盤點可動用的各項財源，在不舉債前提下落實總統要求。