行政院資通安全處30日證實，11月24日九合一選舉投票當日，中選會官網遭分散式阻斷服務攻擊（DDoS）。發生時間在投票前，時間點為上午6點56分至7時1分，攻擊流量為9.7Gbps，由於事前已戒備防護，攻擊流量在未觸及官網前，已及時成功阻擋，中選會官網未受影響，且自7時1分後已無攻擊流量，官網正常提供服務。
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行政院資安處表示，中選會「電腦計票系統」屬內部封閉網路架構，與中選會官網使用的網路系統分離，「電腦計票系統」完全未受此事件影響。
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行政院資安處強調，九合一選舉期間，資安團隊自投票起，到完成計票期間，都全程掌握選舉系統資通安全狀態，未發現再有其他攻擊事件發生。
行政院表示，由於駭客攻擊中選會網站並未成功，因此這次選舉計票結果完全正常，外界不必擔心。