因爭議多時的觀塘案，環保署副署長詹順貴昨在臉書上發出三千字請辭聲明，更稱「從9月13日自行送至政院待核至今，辭意迄今未變。」打臉行政院發言人Kolas Yotaka（谷辣斯‧尤達卡）的咳嗽請假說。環保署署長李應元今（9）日在立法院受訪時表示，技術面不重要，詹順貴確實曾經向他請辭，他當時說完全不考慮，不收他的辭職信，所以當時這件事就沒有了。
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李應元指出，在這過程中，他和詹一直在討論如何解決生態保育跟環評程序問題，如何從實質面減輕對藻礁的衝擊，縮小開發面積，在程序面又能尊重環評委員，9月12日詹順貴主持環評會時，委員們幾乎全員到齊，只有部分委員有公務無法出席，詹也都可以接受這樣的安排，中間都一直有溝通，原本排定10月3日、10月8日再開會，直到昨天上午9點多，詹順貴有先告訴他，他要請辭，到下午他知道無法挽回，才簽下辭呈，努力到最後一分鐘。
媒體問到，在賴揆帶領下，環保署是否受到很多限制？李應元說，詹順貴昨天就表示，「我（李應元）有充分尊重，完全授權，我可以承受所有壓力」，是大家誤解了。
李應元澄清說，外界認為賴清德要求觀塘案要在9月底前過關的消息，不斷誤傳，加上媒體標題而誤導，大家去看，8月27日工商時報的報導，賴揆很清楚要求中油要積極和環評委員溝通，對於質疑或訊問要做出回應，縮小開發面積跟迴避藻礁，積極爭取和力拼過關，這是對中油，而不是針對環評制度和委員本身，這是很大的差異。
李應元指出，昨天雖然有委員不能出席，至少4、5位都提出書面意見，沒到場不代表他不接受程序，是個人因素所致，大家都可以理解。民主跟法制應該要兼顧。
至於行政院是否不諒解詹順貴？ 李應元表示，不是這樣講，行政院發言人昨也表示對詹順貴的貢獻、成就備加肯定，賴清德日前在媒體專訪中對詹順貴在環評效率、兼顧環保的努力，也高度肯定。
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對於詹順貴昨在聲明中表示，這一年來談論政策空間已經變少，甚至提到推動《空氣污染防治法》讓同仁累垮。對此，李應元說，因為《空污法》立法時同仁們都很盡力，壓力很大，詹負責在後勤整理法律，他在前線辯護，整體戰力才能出來，這段過程中有時要跟賴揆、政委們溝通，但畢竟院長不可能每件事都處理，每個院長有不同風格，希望大家瞭解，「這無傷大雅。」
至於是否覺得真心換絕情？李應元笑稱，完全沒有，他是「嘸甘」，但還是要罵詹一句「不顧江湖道義，讓我非常辛苦工作」，他也強調，賴院長沒有給壓力。