今（2018）年2月立法院三讀通過所得稅制優化方案，財政部原打算再推動扣除額稅改，卻突然急踩剎車，讓國民黨立委痛批財政部承諾跳票。財政部政務次長吳自心今（20）日出面解釋，主要是經試算發現，實施所得稅制優化方案後，免稅額及扣除額占綜合所得總額的比率將提高為76%，綜所稅稅基僅餘24%，部長蘇建榮憂心綜所稅會變很脆弱，如何支應未來長照及高齡化所增支出，因此希望先觀察所得稅制優化方案實施後，對稅基及稅收的影響，再進行通盤檢討。
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今年2月7日立法院三讀通過修正所得稅法，實施所得稅制優化方案，綜所稅的減稅利益近500億元，主要是用以調高4項扣除額，包括標準扣除額、薪資所得、身心障礙及幼兒學前特別扣除額，大幅減輕薪資所得者、中低所得者及育兒家庭的租稅負擔，財政部估計有逾542萬申報戶受益。
而原本財政部將再接力於立法院這會期再推動扣除額稅改，今年8月中財政部長蘇建榮就透露，因應政府推動長照政策，新增「長照扣除額」這部分已有共識。此外，據了解，醫療及生育費扣除額也有可能擴及健檢費用等項目，而第二波扣除額稅改方案預計9月底、10月初送行政院審查，希望下半年立法院三讀通過，明年實施，後年報稅適用。
不過，財政部對於扣除額稅改卻突踩剎車，引發國民黨立委不滿，財政部次長吳自心20日則出面說明原因。他指出，部長是財政學者，對財政健全有很強的使命感，尤其在看到一個數據覺得綜所稅的稅基已非常高，依105年度綜所稅申報統計資料，全國622萬申報戶的綜合所得總額約5.80兆元，列報的免稅額及扣除額約3.61兆元，占綜合所得總額比率已高達62%，顯示我國綜合所得總額經減除免稅額及扣除額後，據以核算稅額的綜合所得淨額僅占總所得的38%，而該年度綜所稅的有效稅率（應納稅額/綜合所得總額）僅為5.57%。
若以105年度資料估算，實施免稅額及扣除額占綜合所得總額之比率將提高為76%，綜所稅稅基僅餘24%。吳自心說，也因為這個數字，讓部長覺得綜所稅會變得很脆弱，將來如何支應長照及高齡化所要增加的支持。
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吳自心說，他也非常清楚這時間點要減稅很容易，但要講加稅阻力一定很大，何況部長講的不是加稅，只是希望向社會爭取支持，所得稅制優化方案今年才通過實施，明年申報適用，對於促進投資，增加國民所得，擴大稅基，吸引投資及人才之效益，要一段時間才會顯現，因此希望爭取更多時間觀察有沒有擴大稅基效果，若稅基能擴大，財政部就較有空間調整扣除額。
吳自心並強調，就幕僚來看，這才是負責任的財政部長，像他是政務官可能做一天就負一天的責任，但部長要考慮2、3年的財政狀況，並很勇敢提出這樣的建議，先觀察今年稅改實施效益及稅基成長情形，並配合納稅者權利保護法基本生活費規定的檢討期程，再通盤檢討扣除額規定，也希望立委及社會各界能給予支持。