總統府祕書長陳菊日前出席活動時，對果賤傷農、死刑爭議等問題侃侃而談，民進黨前立委林濁水對此批評，陳菊把自己「升級了」，行使總統本身都不宜的直接指揮各部會的權。對此，總統府今（9）日表示，不認為陳菊的說法有逾越憲政的問題，也不能理解相關說法立據在哪。
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近期水果價格崩跌，影響許多農民生計，陳菊日前參觀農產品市集時表示，今年風調雨順，農產品豐收，雖然農委會在行銷部分有很多很好的機制，不過還是沒有辦法做到盡善完美，如果農產品收購、加工銜接做得不夠好，農委會應該檢討。媒體詢問死刑爭議時，陳菊則說，用慎重態度執行死刑，大概是現在法務部的態度，「死刑的部分，社會需要有高度的共識。」相關說法引發部分人士質疑。
林濁水就在臉書表示，總統府祕書長，是總統府內務「總管家」，過去依法，工作是替總統傳達溝通協調，對外沒有自己的政策意見，現在陳菊把他升級了，行使總統本身都不宜的直接指揮各部會的權。政府當然要照顧農民，但是這樣做？唉。
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總統府發言人黃重諺表示，陳菊當天的說法，主要是對農民的關心，因為今年天候良好，台灣多項農產品均較過去盛產，供給量也都相當多，影響價格，她的說法，是指農產品的供需等相關狀況，農委會已經做了相當程度的努力，但從政府的角度來看，「永遠覺得做得不足」，要持續努力，沒有逾越憲政的問題，也不能理解相關說法的立據在哪。
至於死刑爭議部分，黃重諺則未多加說明。