營運50年的白河水庫，淤積量高達1539萬立方公尺，淤積率達61.3％，為維持白河水庫營運安全並增進地區水資源調度能力，歷年來水利署南區水資源局與嘉南農田水利會積極辦理清淤工作，因清淤工作的執行上需考量水庫供水營運的需求，僅能於枯水期低水位時進行清淤，以降低水庫營運供水影響。
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今年於枯水期趁低水位時除辦理防洪防淤隧道進水口段施工外，亦加強辦理清淤工作，預計今年枯水期可擴大清淤量達30萬立方公尺。
南水局為活化白河水庫積極辦理水庫清淤及改善工作，其中已於103年納入「曾文南化烏山頭水庫治理及穩定南部地區供水計畫」計畫辦理包括新建庫區防洪防淤隧道、大壩壩體改善、2座出水工的改善以及壩前庫區清淤等，除庫區防洪防淤隧道預計於108年7月完工外，其餘皆已完工，防洪防淤隧道完工後可增加22萬立方公尺/年的水力排砂。
為使白河水庫能夠永續經營，更提報「白河水庫後續改善工程計畫」並已於106年4月奉行政院核定列入前瞻基礎建設計畫-水環境建設-水與發展項下推動，並分為二階段執行，第一階段預計108年至111年執行水庫清淤工作，預計清淤280萬立方公尺，使水庫恢復庫容1250萬立方公尺，並增設繞庫防淤設施，水力排砂由約22萬立方公尺/年提高至約37.1萬立方公尺/年。
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第二階段包括自澐水溪越域引水並進行水庫清淤工作，以恢復庫容1500萬立方公尺為目標，預計於115年水庫的入砂量與排砂量可達到平衡。
南水局表示，白河水庫清淤及更新改善工作分階段持續辦理中，並已於前瞻基礎建設計畫納入辦理後續改善工程計畫，除擴大清淤能量外，並增設繞庫防淤設施，相關工程完工後將可整體改善目前淤積嚴重的白河水庫。