管中閔案引發許多大學師生聲援，要求大學自主，甚至呼籲蔡政府應該道歉。行政院長賴清德今（2）日不對道歉一事回應，他同時強調，不允許有人躲在大學自主的護身符後面。
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記者詢問賴清德，針對管中閔案，現在很多包含交大、清大一些大學校長都出來反對政府的決定，希望大學自主，請問行政院的態度？
賴清德回應說，台灣經過這麼多年，再加上許多人犧牲奉獻，才有今天的民主制度。台灣社會是不會允許政府，政府也不敢去傷害大學自主。同時，社會也不會接受任何一個人，以大學自主作為護身符躲在後面，而迴避個人責任。
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賴清德表示，關鍵在於，教育部的准駁有沒有依據當選人的適法性及適格性做判斷，這部分社會是可以公評的，政府也希望教育部能夠公開向社會說明清楚，社會應該理性看待這件事。
記者再問，台大自主聯盟還要求您道歉，您會道歉嗎？賴清德說，「我剛剛已經講了，謝謝。」