民進黨為了「卡管案」，先是陣亡一個教育部長潘文忠，行政院長賴清德急找吳茂昆上陣，沒想到「卡管」還是未定之數，吳茂昆卻先惹了一身腥，從國科會主委到東華大學校長，不管是補助案、獎助金、專利案、一路到慶富董事，吳茂昆始終跟「錢」脫不了關係，不只外界觀感不佳，連民進黨立委究竟要不要為這位新教長護航，也呈現兩難的狀況。
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據了解，吳茂昆昨跟民進黨立院教育政策小組開會，原先重點是要討論未來教育政策法案，但吳茂昆最近被藍委爆料盯的滿頭包，連綠委都不知道要不要幫他背書，因此乾脆在會中攤開來講，吳茂昆也一一釐清爭議。
與會的綠委吳思瑤表示，吳茂昆在會中強調，第一，他的確是專利發明人，第二，專利屬於東華大學，第三，他在師沛恩公司沒有任何兼職，第四，他太太是用個人身分去投資，目的是鼓勵學生研發，可以跟產業鍊結，是拿自己的錢鼓勵學生創業、幫忙研發，可以成為產學鍊結，全都是正向和善意，並沒有所謂國民黨立委所說的得到不當利益。
對於吳茂昆所言，她是否全然相信？吳思瑤說，「信者恆信，不信者恆不信」，不相信的人，就應該要去舉證，「就像有人指控吳思瑤不是女生，指控的人應該要負舉證責任」，她認為挑戰者要拿出說法，否則就是無罪推定。
民進黨團書記長許智傑則說，不管是教長或台大校長，誠實是共同標準，自己有任何問題，應該要主動面對所有爭議，有問題就應主動出來說明，像吳茂昆和先前的內政部長葉俊榮，都有主動釋疑，但管中閔卻沒有誠實出來面對，「沒有自律，哪來自主？」，他強調，誠實跟自律是當校長的基本條件。
許智傑指出說，像赴陸兼課的事，吳茂昆第一時間就出面說明，他去大陸是講座不是兼課，是臨時性的學術交流，管中閔是不是應該也要講清楚，而不是讓中國大陸來回答。
至於開設公司這件事，他則認為，吳茂昆應該要說的更清楚，是否是為了把專利申請給東華大學才去開公司？「如果專利是個人所有，就是吳茂昆不對，如果專利是東華大學所有，那這件事就是對的」，對於這間公司有無侵權問題，吳茂昆也必須講得更清楚。
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許智傑也以中研院前院長翁啟惠為例說，像翁的案子就很可惜，一個台灣出色的科學家，最後落得如此下場，他說，有時極端的理想跟現實之間，會有些「asobi（日文間隙之意）」沒辦法百分之百吻合，台灣很多會把疏忽、或不是故意的小錯，把它無限上綱，一直挖下去。
許智傑坦承，之前確實沒想到吳茂昆有這些問題，但他也是抱持著無罪推定原則，至於要不要幫吳茂昆背書，許智傑沒那麼快下定論，畢竟還有多少未爆彈，恐怕綠委也不敢全然篤定。