根據週刊報導，資策會執行長于孝斌的前妻Grace越洋控訴，指稱「去年5月因為于和她的已婚閨蜜通姦而離婚，且于為了回台灣接任執行長職務，甚至拋棄對女兒的監護權！」對此，于孝斌今（10）日發布聲明稿，除了表達因為自己的私事而讓資策會受到牽連感到抱歉之外，也坦承確實有過一段失敗的婚姻，但他否認拋棄女兒監護權與接任職務的關聯性，且合理懷疑該報導是有心人對於他4個月來推動各項革新的阻撓與構陷。
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根據《壹週刊》報導，于孝斌的前妻Grace越洋控訴，指控于孝斌在美國時和她的已婚閨蜜通姦，導致他們夫妻在去年5月因而離婚。Grace還爆料指出，于為了回台灣出任執行長的職務，甚至拋棄對女兒的監護權。
對此，于孝斌發布3點聲明。他坦承有過一段失敗的婚姻，並已對此負責，但對於因該報導使得資策會遭受牽連，深感抱歉，並強調離婚事件與他接受資策會職務時間差達5個月，兩者並無關聯性。
對於女兒監護權，于孝斌說：「本人自2017年5月中旬在美協議離婚，並於同年8月2日獲美國馬里蘭州巡迴法庭認證生效，其後李世光董事長於10月中旬就任本會董事長並徵召他出任執行長，與周刊報導所謂為了出任執行長拋棄監護權並無關聯性。」
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此外，于孝斌在聲明稿中也懷疑，該篇報導是想阻撓資策會的會務革新。
他指出，他自11月1日就任以來，陸續推動包含研發布局、組織制度、與內部溝通等各項革新業務與國際合作，致力精簡內部高層人事，並廣召各界意見領袖共同參與策略會議，以落實組織文化重建，該報導選在董事會前一天發布他家庭私務，可合理懷疑為對他4個月來推動各項革新的阻撓與構陷。