虎頭溪大部分流域屬台南市新化區，但每當颱風豪雨來襲均因排水系統無法宣洩，淹水災情頻傳，為使居民早日擺脫水患之苦，台南市長參選人、立委黃偉哲協助台南市政府向經濟部水利署爭取6千7百萬元「新化區虎頭溪排水大目橋上下游護岸改善工程」經費，工程106年12月底完工，期有效改善當地洪水溢淹情形，確保民眾生命財產安全。
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第六河川局表示，虎頭溪排水系統為鹽水溪上游支流，以虎頭埤為界將主要水路分為上游虎源溪與下游虎頭溪，兩側工程長度為1,696公尺，除施作懸臂式RC及砌石混凝土護岸，一併進行河道拓寬與疏濬作業，自105年6月施工，106年底完工。
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黃偉哲表示，新化區多年淹水主因為下游地勢低窪、排水路通水斷面及護岸高度不足、排水路遭異物堵塞等因素，而莫拉克、凡那比颱風侵襲時，虎頭溪原排水系統等無法將溢出的洪水排入鹽水溪，造成淹水情形特別嚴重，現人口較多的大目橋一帶排水改善工程竣工，可減輕地方淹水狀況。
黃偉哲指出，有關新化區虎頭溪排水整治，除大目橋上下游改善外，他亦協助市府向水利署爭取改善工程一工區及二工區共7千萬元經費，目前正在施工中，預計3月底4月初完工，屆時防洪能力將大力提升。