尼莎颱風造成全台校園多處損害，根據教育部統計，全台各受災學校共計199校，以宜蘭縣75校最多，台北市66校次之，新北市29校第三。
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總災損金額初估1,780萬餘元。台北市災損974萬第一，宜蘭縣災損477萬餘元次之，第三為新北市災損207萬餘元。其中台北市立石牌國小605萬餘元（斜屋頂及多輛汽機車毀損），宜蘭縣中道高中70萬元次之（高爾夫及棒球打擊場毀損），新北市立瑞芳國小69萬元（活動中心屋頂毀損）。
教育部表示，目前共計有國立彰化師範大學與馬偕醫學院等2校、41人進行戶外教學，本部皆與領隊（老師）取得聯繫，目前隊伍調整於室內進行相關活動，無安全疑慮。