受到尼莎颱風於29日晚間，將在花蓮一帶登陸，全台灣都會籠罩於暴風圈中，高雄市旗山地區，都已進入緊鑼密鼓階段，進行防颱準備，隨時因應颱風可能帶來的嚴重威脅。
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國軍八軍團四支部於28日即調派先遣部隊，進入高雄市偏遠山區的桃源及那瑪夏，截至目前為止，由少校王正智帶領陸戰隊特勤隊員及1/2偵搜車1輛 ，共計從桃源區勤和里第二次強制性撤離1200多位居民，分別安置於各里的避難所。
杉林區預防性撤離任務，29日下午由帶隊官蕭丘煥上尉指揮悍馬車3輛、兵力10員，從旗山圓潭華山營區出發，13點40分抵達杉林區公所，會合杉林警消人員接受指揮官上校大隊長雷詠淇的勤前教育後，於14點分3路綫出發前往集來、木梓及金興山區，預計撤離50戶150位民眾，安置在杉材林大愛園區。
杉林警消人員在杉林區公所前會合，接受指揮官上校大隊長雷詠淇的勤前教育。（圖／記者宋汝夔攝，2017.07.29）
甲仙區預防性撤離任務，29日下午由帶隊官上尉許瓏襦上尉指揮悍馬車1輛、中型戰術輪車1輛、兵力10員，也是從旗山圓潭華山營區出發，下午2點抵達甲仙區公所，會合甲仙警消人員後出發前往山區，預計撤離308位民眾，同樣安置在杉材林大愛園區。
美濃中正湖從28日起，就預先進行調節式洩洪，排放湖內原本滿水位的儲水，以備美濃溪漲至警戒線時，隨時關閉水門儲水，達到蓄水防洪功效。
美濃中正湖從28日起，就預先進行調節式洩洪，排放湖內原本滿水位的儲水，以備美濃溪漲至警戒線時，隨時關閉水門儲水，達到蓄水防洪功效。（圖／記者郭瑞萍攝，2017.07.29）
旗山分局轄區內各分駐所及派出所，分別派出員警至溪邊、河床、堤防、山區等潛在危險地區，勸導民眾勿於溪邊垂釣、逗留，以免發生危險。
旗山消防分隊在分隊長林益收的帶領下，將橡皮艇、救生設備等相關機具，及義消人員的調遣，重新調整待命，準備好隨時出發搶救災難。
旗山消防分隊在分隊長林益收的帶領下，將橡皮艇、救生設備等相關機具，及義消人員的調遣，重新調整待命，準備好隨時出發搶救災難。（圖／記者許薰方攝，2017.07.29）
高雄市政府許銘春副市長，也於29日11點半左右，前往旗山區華中街，審查五號排水工程，督促施工單位切實執行，以免延誤工期影響防汛救災。
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另外就是高雄市政府宣布，7月29日晚上已達停止上班及停止上課標準，高雄市7月29日晚上18時起，停止上班、停止上課。
為避免山區發生道路坍塌意外，甲仙工務段將於29日晚上20點，封閉台20線桃源區勤和到復興路段，以及台29線甲仙小林里五里埔到那瑪夏區民族里路段。