因應少子化，多所大學提出合併尋找更多契機，教育部提出大學可公私立合併，國立中山大學與高雄醫學大學多年合作，成立「中山高醫攻頂大學聯盟」，除推動跨校整合學程、輔系及雙主修，畢業時可獲兩所大學認證；在兩校積極爭取下，現又獲教育部同意，兩校大學生轉校轉系名額放寬，成為「國內公私立大學互轉不受對等人數限制」的首例。
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106學年度中山大學開放全校21學系，高雄醫學大學除醫學系、腎臟照護學系、牙醫學系及醫學影像暨放射科學系等4學系，受限於教育部及衛生福利部的醫學名額管控相關規定而不開放，其餘17學系皆開放申請。中山和高醫大學部學生透過書面審查和面試，經核可後即可轉校轉系。
中山大學校長鄭英耀表示，兩校合作多年，為鼓勵學生選擇適性領域修讀，並增加學生跨領域機會，繼實施「跨校輔系」、「跨校雙主修」提供兩校學生選讀跨領域學門科系後，104年便試辦轉校轉系此一實驗性創舉。兩校經過謹慎評估與多次會議討論，並向教育部積極爭取，終於在今年打破互轉人數限制，再次創下公私立大學合作紀錄，更進一步落實「選擇中山擁有高醫，選擇高醫擁有中山」的策略。
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中山大學教務長黃心雅進一步說明，本次教育部同意核定106至107學年度「國立中山大學及高雄醫學大學試辦學生轉校計畫」，相較於前兩年，最大的突破是，取消了兩校學生錄取人數應對等（即若一名中山學生轉至高醫，僅能有一名高醫學生轉來中山）的規定，而是改以「兩校實際錄取人數不超過兩校學士班缺額之20%」，及「兩校辦理轉校及轉學後之各年級學生總數不得超過原核定新生總數」等原則進行控管，此一修正將使得兩校轉校名額更有彈性，對於提升學生競爭力與培育優質人力有實際幫助。
中山與高醫兩校自101年合作迄今，五年來研究關係更形密切，研究廣度擴增，重點包括醫藥化學、藥理毒理學、環境醫學、轉譯醫學、新藥開發、醫學工程、音樂治療、醫療器材、醫療管理、人文科學及其他雙方認可等項目。兩校共同發表的論文數量也逐年增加，每年都有10%的成長率，去年兩校合作發表論文共有292篇。