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針對海上巡緝、港口安檢及岸際巡邏等強化邊境管制，已要求所轄單位倘於執勤時發現疑似病例或疫情，查明船舶航線、目的地與注意船上人員身體狀況等，立即通報檢疫及衛生單位處理，待返港後完成船艇、人員及違法船舶清潔及消毒工作，以防範疫情擴散境內。
若倘查獲不明野生動物或偷渡人員時，應保持現狀，拉起封鎖帶管制人員進出與物品異動，立即通報防檢疫及衛生單位到場處理；另要求全體同仁做好自主健康管理，如有身體不適，應儘速就醫，以維護人員及勤務安全。
第九岸巡隊副隊長王榮忠表示，為防範武漢新型冠狀病毒肺炎疫情持續蔓延，將持續強化灘岸巡查勤務及嚴加觀察小三通貨運船舶人員及旅客是否有感染跡象，未來將秉持「寧願多做、不可少做」、「做好長期抗戰的準備」、「以最嚴謹的態度面對疫情」及「用最高標準執行勤務」等4項原則，持續強化疫情防堵工作。
